Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH16O75452 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RDH16O75452 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDH16O75452 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDH16O75452 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDH16O75452 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH16O75452 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH16O75452 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH16O75452 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH16O75452 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH16O75452 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH16O75452 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH16O75452 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH16O75452 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH16O75452 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH16O75452 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH16O75452 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDH16O75452 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDH16O75452 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDH16O75452 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RDH16O75452 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDH16O75452 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDH16O75452 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDH16O75452 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH16O75452 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH16O75452 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH16O75452 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH16O75452 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH16O75452 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH16O75452 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDH16O75452 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDH16O75452 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDH16O75452 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDH16O75452 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDH16O75452 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH16O75452 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH16O75452 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH16O75452 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH16O75452 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH16O75452 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH16O75452 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH16O75452 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH16O75452 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH16O75452 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH16O75452 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH16O75452 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH16O75452 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH16O75452 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH16O75452 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH16O75452 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH16O75452 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH16O75452 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH16O75452 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH16O75452 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH16O75452 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH16O75452 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH16O75452 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH16O75452 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH16O75452 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH16O75452 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH16O75452 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH16O75452 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH16O75452 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH16O75452 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH16O75452 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH16O75452 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH16O75452 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH16O75452 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH16O75452 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH16O75452 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH16O75452 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH16O75452 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH16O75452 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH16O75452 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH16O75452 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH16O75452 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH16O75452 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH16O75452 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH16O75452 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH16O75452 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH16O75452 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH16O75452 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH16O75452 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH16O75452 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms