Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTIPO60759 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTIPO60759 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTIPO60759 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTIPO60759 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms