Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRKAB2O43741 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKAB2O43741 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKAB2O43741 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKAB2O43741 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKAB2O43741 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms