Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP2AO43633 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHMP2AO43633 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHMP2AO43633 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP2AO43633 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP2AO43633 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms