Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops5O35864 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cops5O35864 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cops5O35864 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops5O35864 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops5O35864 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops5O35864 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops5O35864 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cops5O35864 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops5O35864 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops5O35864 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops5O35864 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops5O35864 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops5O35864 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms