Protein–RNA interactions for Protein: G3X9J0

Sipa1l3, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1l3G3X9J0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sipa1l3G3X9J0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sipa1l3G3X9J0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sipa1l3G3X9J0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sipa1l3G3X9J0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sipa1l3G3X9J0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sipa1l3G3X9J0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sipa1l3G3X9J0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sipa1l3G3X9J0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sipa1l3G3X9J0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms