Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Erich3F6QRE9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Erich3F6QRE9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Erich3F6QRE9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Erich3F6QRE9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Erich3F6QRE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Erich3F6QRE9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Erich3F6QRE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms