Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp54bE9PXC0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54bE9PXC0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp54bE9PXC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54bE9PXC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srp54bE9PXC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms