Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30bE9PVL6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30bE9PVL6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim30bE9PVL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim30bE9PVL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim30bE9PVL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim30bE9PVL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms