Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PATL2C9JE40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PATL2C9JE40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PATL2C9JE40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PATL2C9JE40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PATL2C9JE40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms