Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200CA6NKL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM200CA6NKL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMEM200CA6NKL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM200CA6NKL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms