Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf60A6NFR6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf60A6NFR6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf60A6NFR6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf60A6NFR6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms