Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
1700003F12RikA2AKE5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
1700003F12RikA2AKE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700003F12RikA2AKE5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700003F12RikA2AKE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
1700003F12RikA2AKE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms