Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms