Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD54BQ9Y620 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD54BQ9Y620 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms