Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG6Q9Y2V7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms