Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF5Q9Y2D1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF5Q9Y2D1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms