Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNND2Q9UQB3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNND2Q9UQB3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms