Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRQQ9UMZ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRQQ9UMZ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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