Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TPCN1Q9ULQ1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPCN1Q9ULQ1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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