Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXL4Q9UKA2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms