Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EXTL2Q9UBQ6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms