Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPASTQ9UBP0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPASTQ9UBP0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms