Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGAP28Q9P2N2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms