Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL9Q9P2J3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms