Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms