Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PODXL2Q9NZ53 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PODXL2Q9NZ53 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms