Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTBP3Q9NS15 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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