Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHST12Q9NRB3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms