Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1BQ9H9Y6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms