Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLIRPQ9GZT3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms