Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT1B-201ENST00000334346 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 RMDN2-AS1-201ENST00000414365 859 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590302.2-201ENST00000435810 1122 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF35-206ENST00000453164 581 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026444.1-201ENST00000502592 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM173B-205ENST00000510047 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUTF2P6-201ENST00000560892 385 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016747.3-201ENST00000609422 791 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079602.4-201ENST00000637836 532 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP19A1-204ENST00000405913 1697 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOSC9-201ENST00000243498 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355312.2-201ENST00000455607 1541 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKR1C4-201ENST00000263126 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO16-201ENST00000346498 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR51T1-202ENST00000380378 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAV17-201ENST00000390445 484 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 TM2D3-203ENST00000428002 1267 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073475.1-201ENST00000434012 592 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms