Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC8Q9BY41 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms