Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT17Q9BSW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT17Q9BSW7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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