Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms