Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MESP1Q9BRJ9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms