Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM83CQ9BQN1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM83CQ9BQN1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms