Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms