Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EYA1Q99502 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms