Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMTK3Q96Q04 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms