Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OPALINQ96PE5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPALINQ96PE5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms