Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NSMCE2Q96MF7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms