Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEURL4Q96JN8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEURL4Q96JN8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms