Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms