Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TRIM63Q969Q1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM63Q969Q1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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