Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAVIN3Q969G5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms