Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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