Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC112Q8NEF3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC112Q8NEF3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms