Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms