Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZIC4Q8N9L1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms